Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2035J3QP87 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm2035J3QP87 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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