Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm21798J3QNU5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Gm21798J3QNU5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm21798J3QNU5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
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Gm21798J3QNU5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
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Gm21798J3QNU5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Gm21798J3QNU5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21798J3QNU5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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