Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm28038F7BCN9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gm28038F7BCN9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms