Protein–RNA interactions for Protein: F6XWB2

Igkv1-99, Immunoglobulin kappa variable 1-99 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-99F6XWB2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Igkv1-99F6XWB2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Igkv1-99F6XWB2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms