Protein–RNA interactions for Protein: F6VWU8

Zfp946, Zinc finger protein 946, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp946F6VWU8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Zfp946F6VWU8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Zfp946F6VWU8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms