Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5861F6VCN9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm5861F6VCN9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms