Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx6-2D3Z4R4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms