Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Prr29B1ARI9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Prr29B1ARI9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prr29B1ARI9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms