Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r232A2RTT5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r232A2RTT5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r232A2RTT5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Vmn1r232A2RTT5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r232A2RTT5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r232A2RTT5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r232A2RTT5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r232A2RTT5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Vmn1r232A2RTT5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r232A2RTT5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms