Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 Ly6i-202ENSMUST00000166694 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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Rpusd2Q149F1 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Lypla1-203ENSMUST00000119612 529 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm16222-201ENSMUST00000124320 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Stamos-201ENSMUST00000152524 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm24078-201ENSMUST00000158184 103 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rpusd2Q149F1 Gm28199-201ENSMUST00000187127 619 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
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