Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Fer1l5-202ENSMUST00000179162 6315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Celf5-202ENSMUST00000119060 4166 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ppp1r32-201ENSMUST00000038842 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Srcap-201ENSMUST00000066582 4545 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm5909-201ENSMUST00000119768 1281 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Mir6941-201ENSMUST00000184711 59 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC154176.1-201ENSMUST00000225897 220 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Atp6v1h-205ENSMUST00000192847 1662 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm45354-201ENSMUST00000199820 2557 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm2035J3QP87 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms