Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Aqr-202ENSMUST00000102543 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 4933425M03Rik-201ENSMUST00000195991 1544 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Plac9a-203ENSMUST00000183725 439 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Plac9b-202ENSMUST00000183811 396 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Tacc2-205ENSMUST00000207282 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Qtrt2-201ENSMUST00000023387 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Arih2-201ENSMUST00000013338 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm15264-201ENSMUST00000118050 502 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Zbed5B2RPU8 Gm17190-202ENSMUST00000185178 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms