Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 R3hdm2-218ENSMUST00000170336 3639 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Dctn1-204ENSMUST00000113918 4321 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Kit-201ENSMUST00000005815 5214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Kmt2a-201ENSMUST00000002095 16461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Disp2-201ENSMUST00000037547 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Tchhl1-201ENSMUST00000029516 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Fyco1-201ENSMUST00000084715 7949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm26614-201ENSMUST00000180386 3909 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Fbxo38-201ENSMUST00000048688 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ncapd3-202ENSMUST00000086198 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Nsd3-201ENSMUST00000084026 9945 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Rreb1-207ENSMUST00000128570 8436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Gm3550W4VSN7 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms