Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Smpd4-218ENSMUST00000170273 2166 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Gm11824-201ENSMUST00000120191 846 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Gm38313-201ENSMUST00000191953 1266 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Olfr582-203ENSMUST00000211036 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Fcrl1-202ENSMUST00000163661 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Prim2-201ENSMUST00000027312 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Atf6F6VAN0 Arhgap15os-201ENSMUST00000139948 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.9□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Platr12-201ENSMUST00000141027 462 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm42780-201ENSMUST00000197083 734 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Zfp474-201ENSMUST00000072666 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Atf6F6VAN0 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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