Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Jag1Q9QXX0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jag1Q9QXX0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jag1Q9QXX0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms