Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
MBD5Q9P267 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MBD5Q9P267 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC33.85■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MBD5Q9P267 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms