Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nectin3Q9JLB9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nectin3Q9JLB9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nectin3Q9JLB9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms