Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot9Q9JKY0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cnot9Q9JKY0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cnot9Q9JKY0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms