Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rcan3Q9JKK0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rcan3Q9JKK0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rcan3Q9JKK0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms