Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ush1cQ9ES64 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ush1cQ9ES64 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ush1cQ9ES64 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms