Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Chrnb2Q9ERK7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Chrnb2Q9ERK7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.4 ms