Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Wdr61Q9ERF3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Wdr61Q9ERF3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms