Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7I0

Shisa5, Protein shisa-5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa5Q9D7I0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa5Q9D7I0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa5Q9D7I0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms