Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syf2Q9D198 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syf2Q9D198 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms