Protein–RNA interactions for Protein: Q9D110

Mthfs, 5-formyltetrahydrofolate cyclo-ligase, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MthfsQ9D110 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MthfsQ9D110 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
MthfsQ9D110 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MthfsQ9D110 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms