Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rab3bQ9CZT8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rab3bQ9CZT8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rab3bQ9CZT8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms