Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Xrcc3Q9CXE6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Xrcc3Q9CXE6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Xrcc3Q9CXE6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Xrcc3Q9CXE6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Xrcc3Q9CXE6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Xrcc3Q9CXE6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Xrcc3Q9CXE6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Xrcc3Q9CXE6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Xrcc3Q9CXE6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Xrcc3Q9CXE6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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