Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH1

Zbtb8a, Zinc finger and BTB domain-containing protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb8aQ9CWH1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb8aQ9CWH1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb8aQ9CWH1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb8aQ9CWH1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb8aQ9CWH1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb8aQ9CWH1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb8aQ9CWH1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb8aQ9CWH1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb8aQ9CWH1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zbtb8aQ9CWH1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zbtb8aQ9CWH1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zbtb8aQ9CWH1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zbtb8aQ9CWH1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms