Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
StambpQ9CQ26 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
StambpQ9CQ26 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
StambpQ9CQ26 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms