Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GpnmbQ99P91 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GpnmbQ99P91 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms