Protein–RNA interactions for Protein: Q99MD6

Txnrd3, Thioredoxin reductase 3, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd3Q99MD6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Txnrd3Q99MD6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Txnrd3Q99MD6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Txnrd3Q99MD6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms