Protein–RNA interactions for Protein: Q99L43

Cds2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds2Q99L43 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cds2Q99L43 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cds2Q99L43 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms