Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Prpf19Q99KP6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Prpf19Q99KP6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Prpf19Q99KP6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms