Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmed9Q99KF1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmed9Q99KF1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms