Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF7

SMIM8, Small integral membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM8Q96KF7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SMIM8Q96KF7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMIM8Q96KF7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms