Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ApobrQ8VBT6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ApobrQ8VBT6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ApobrQ8VBT6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ApobrQ8VBT6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms