Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GADD45GIP1Q8TAE8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GADD45GIP1Q8TAE8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms