Protein–RNA interactions for Protein: Q8K310

Matr3, Matrin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Matr3Q8K310 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Matr3Q8K310 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Matr3Q8K310 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Matr3Q8K310 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms