Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rab11fip3Q8CHD8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rab11fip3Q8CHD8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rab11fip3Q8CHD8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
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