Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG48

Smc2, Structural maintenance of chromosomes protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc2Q8CG48 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc2Q8CG48 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Smc2Q8CG48 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smc2Q8CG48 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smc2Q8CG48 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms