Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HAPLN4Q86UW8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HAPLN4Q86UW8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms