Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrrc1Q80VQ1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
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