Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPS0

Rps6ka6, Ribosomal protein S6 kinase alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka6Q7TPS0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Rps6ka6Q7TPS0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rps6ka6Q7TPS0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms