Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NinlQ6ZQ12 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
NinlQ6ZQ12 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NinlQ6ZQ12 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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