Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pdcd11Q6NS46 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pdcd11Q6NS46 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pdcd11Q6NS46 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Pdcd11Q6NS46 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms