Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Top2bQ64511 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
Top2bQ64511 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Top2bQ64511 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Top2bQ64511 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms