Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Spire1Q52KF3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Spire1Q52KF3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Spire1Q52KF3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms