Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Snx27Q3UHD6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Snx27Q3UHD6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Snx27Q3UHD6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms