Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Calr4Q3TQS0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Calr4Q3TQS0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Calr4Q3TQS0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms