Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cers3Q1A3B0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cers3Q1A3B0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms